珠心算教學活動依據著「內隱記憶」和「腦影像」等科學及醫學理據。珠心算啟動兒童的大腦潛在功能，有利於人的右腦發展。珠心算訓練進行時兒童須要眼到、耳到、手到和心、腦齊到。珠心算是鍛鍊思考、提升專注力、增強學習能力的最佳培訓計劃之一。珠心算訓練提升了大腦認知功能的塑造和發展。珠心算訓練也提升了學生的注意力和視覺資訊搜索能力。珠心算訓練改善專心專注的能力，數感能力、知覺速度和平面空間想像力和數位記憶等能力。
在醫學研究上，大阪府立大學教授的林壽郎博士指出: 「愈早提供有效的珠心算訓練給幼童就愈容易為他們開通腦部的潛能。訓練右腦能減少得到癡呆症的機會。近期研究已證實珠心算教育中的心算訓練是最有效開通右腦潛能的方法。」 香港中文大學教育行政與政策學系的張志強教授亦教導: 「學習珠心算是有效地刺激腦袋的最佳訓練之一，透過手指指尖刺激神經元，例如聽數撥珠，就能有效地訓練右腦。 右腦的訓練能夠提升小朋友的立體感、創意和藝術感。 」
有見及此,學習珠心算可快速提升學生們的運算速度和能力，全腦型的訓練計劃能有效地發展學生們的多元智能；小朋友的自信心、情緒智商、專注力和記憶力一旦得到增強 ，求學的態度和各學科的成績表現亦自然會得到改善。珠心算訓練提高大腦左側感知運動皮層的灰質密度，強化大腦纖維束起到的連接作用。
